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Während einer Patrouille im Raum der Föderation stößt die U.S.S. Shenzhou auf ein Objekt unbekannter Herkunft und stellt den Ersten Offizier Michael Burnham auf die bislang größte Probe.

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Klingonischen Schiffen gegenüberstehend, bereitet sich die U.S.S. Shenzhou auf die Möglichkeit eines Krieges vor, falls die Verhandlungen scheitern sollten. Inmitten der Turbulenzen blickt Burnham zur Orientierung auf ihre vulkanische Erziehung zurück.

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Burnham befindet sich nun an Bord der U.S.S. Discovery. Sie merkt schnell, dass die Dinge nicht so sind, wie sie scheinen, einschließlich des mysteriösen Kapitäns Gabriel Lorca.

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Angesichts der Spannungen und des hohen Einsatzes der Sternenflotte bei ihren Bemühungen, den Krieg mit den Klingonen zu beenden, beginnt Burnham, sich in an ihre neue Position an Bord der U.S.S. Discovery zu gewöhnen.

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Lorca befindet sich unerwartet in der Gesellschaft eines Kriegsgefangenen, des Sternenflottenleutnants Ash Tyler, und des berüchtigten intergalaktischen Verbrechers Harry Mudd. Währenddessen äußert sich Burnham besorgt über die Auswirkungen der Sporenantrieb-Sprünge auf "Ripper".

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Die Crew der U.S.S. Discovery ist fasziniert von dem Neuzugang Leutnant Ash Tyler. Sarek sucht Burnhams Hilfe und weckt Erinnerungen an ihre Vergangenheit. Admiral Cornwell hinterfragt Lorcas Taktik.

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Während die Crew der U.S.S. Discovery versucht, sich auf einer Party zu entspannen, kommt ein unerwünschter Besucher an Bord, der eine problematische und verdrehte Abfolge von Ereignissen hervorruft.

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Die U.S.S. Discovery hat den Auftrag, den Planeten Pahvo zu erforschen und die Wissenschaft hinter der Tarntechnologie der Klingonen zu erlernen.

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Während sie sich in unbekanntem Gebiet aufhalten, ist die Crew der U.S.S. Discovery gezwungen, kreativ zu werden, um gegnerische und beispiellose Kräfte zu überleben und nach Hause zurückzukehren.

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Burnham und Tyler brechen zu einer Mission auf, um den Widerstand vor der Vernichtung durch das irdische Imperium zu bewahren, in der Hoffnung, nach Hause zurückzukehren. Währenddessen arbeitet Tilly daran, die Neurofunktion von Stamets wiederherzustellen.

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Burnham begibt sich mit einem besonderen "Geschenk" für den Imperator zur ISS Charon. Mit Hilfe einer unerwarteten Quelle gewinnt Stamets an Klarheit, während er im Myzelgeflecht gefangen ist. Saru bittet L'Rell um Hilfe.

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Lorca plant einen Putsch gegen den Imperator und treibt Burnham dazu an, eine schnelle Entscheidung zu treffen, um nicht nur sich selbst, sondern auch die U.S.S. Discovery zu retten.

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Während der Abwesenheit von Burnham und der Crew der U.S.S. Discovery ist die Sternenflotte mit der harten Realität des Krieges konfrontiert. Um voranzukommen, muss sie unkonventionelle Taktiken und Quellen einsetzen, um ihre nächste Aktion gegen die Klingonen zu starten.

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Mit Georgiou an der Spitze und um den klingonischen Krieg ein für alle Mal zu beenden, bemüht sich die Crew der U.S.S. Discovery, ihre feindlichen Taktiken zu ergründen und zu tolerieren. Erinnerungen an vergangene Nöte werden in Burnham neu entfacht.